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Point accepted mutation

Índice Point accepted mutation

El conjunto de matrices PAM, o Point Accepted Mutation (del inglés, mutación puntual aceptada), también Percent Accepted Mutation, y también matriz de datos de mutación de Dayhoff o MD, es un conjunto de matrices de mutación de péptidos, o matrices de sustitución, calculado por Margaret Dayhoff a finales de los años 70 del pasado siglo, en lo que se convertiría en un trabajo determinante en el campo de la bioinformática.

14 relaciones: Alineamiento de secuencias, Alineamiento múltiple de secuencias, Aminoácido, Bioinformática, BLOSUM, Margaret Oakley Dayhoff, Matriz (matemática), Matriz cuadrada, Matriz de sustitución, Matriz simétrica, Mutación, Mutación genética, Péptido, Probabilidad.

Alineamiento de secuencias

Un alineamiento de secuencias en bioinformática es una forma de representar y comparar dos o más secuencias o cadenas de ADN, ARN, o estructuras primarias proteicas para resaltar sus zonas de similitud, que podrían indicar relaciones funcionales o evolutivas entre los genes o proteínas consultados.

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Alineamiento múltiple de secuencias

Un alineamiento múltiple de secuencias (Multiple sequence alignment MSA, por sus siglas en inglés) es un alineamiento de tres o más secuencias biológicas, generalmente proteínas, ADN o ARN.

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Aminoácido

Un aminoácido (a veces abreviado como AA), es una molécula orgánica con un grupo amino (-NH2) y un grupo carboxilo (-COOH) en un extremo.

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Bioinformática

La bioinformática puede definirse, de manera general, como la aplicación de tecnologías computacionales y la estadística a la gestión y análisis de datos biológicos.

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BLOSUM

BLOSUM (BLOcks of Amino Acid SUbstitution Matrix, o matriz de sustitución de bloques de aminoácidos) es una matriz de sustitución utilizada para el alineamiento de secuencias de proteínas.

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Margaret Oakley Dayhoff

Margaret Belle (Oakley) Dayhoff (11 de marzo de 1925 - 5 de febrero de 1983) fue una fisicoquímica estadounidense y pionera en el campo de la bioinformática.

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Matriz (matemática)

En matemática, una matriz es un conjunto bidimensional de números.

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Matriz cuadrada

Una matriz A de n por m elementos, es una matriz cuadrada si el número de filas es igual al número columnas, es decir, n.

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Matriz de sustitución

En biología evolutiva una matriz de sustitución, o de puntuación, describe el ritmo al que un carácter en una secuencia cambia a otro carácter con el tiempo.

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Matriz simétrica

Una matriz es simétrica si es una matriz cuadrada, la cual tiene la característica de ser igual a su traspuesta.

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Mutación

Una mutación es el cambio al azar en la secuencia de nucleótidos o en la organización del ADN (genotipo) o ARN de un ser vivo que produce una variación en las características de este y que no necesariamente se transmite a la descendencia.

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Mutación genética

En genética, se denomina mutación genética, mutación molecular o mutación puntual a los cambios que alteran la secuencia de nucleótidos del ADN.

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Péptido

Los péptidos son un tipo de molécula formadas por la unión de varios aminoácidos mediante enlaces peptídicos.

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Probabilidad

La probabilidad es una medida de la certidumbre de que ocurra un evento.

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Redirecciona aquí:

PAM (bioinformatica), PAM (bioinformática), Point Accepted Mutation.

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