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Pfam

Índice Pfam

Pfam es una base de datos que reúne una amplia colección de alineamientos múltiples de secuencias y modelos ocultos de Márkov que cubre buena parte de dominios proteicos y familias comunes.

8 relaciones: Alineamiento múltiple de secuencias, Base de datos, Dominio proteico, Estructura de las proteínas, InterPro, Modelo oculto de Márkov, Protein Data Bank, Wellcome Trust Sanger Institute.

Alineamiento múltiple de secuencias

Un alineamiento múltiple de secuencias (Multiple sequence alignment MSA, por sus siglas en inglés) es un alineamiento de tres o más secuencias biológicas, generalmente proteínas, ADN o ARN.

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Base de datos

Una base de datos (del inglés: database) se encarga no solo de almacenar datos, sino también de conectarlos entre sí en una unidad lógica.

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Dominio proteico

Un dominio proteico es la zona de la proteína donde se encuentra mayor densidad, es decir, donde hay más plegamientos.

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Estructura de las proteínas

La estructura de las proteínas reúne las propiedades de disposición en el espacio de las moléculas de proteína que provienen de su secuencia de aminoácidos, las características físicas de su entorno y la presencia de compuestos simples o complejos que las estabilicen y conduzcan a un plegamiento específico.

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InterPro

InterPro es una plataforma con acceso a base de datos de familias, dominios y sitios funcionales de proteínas en donde las características identificables encontradas en proteínas conocidas pueden ser aplicadas a nuevas secuencias de proteínas.

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Modelo oculto de Márkov

Un modelo oculto de Márkov o HMM (por sus siglas del inglés, Hidden Markov Model) es un modelo estadístico en el que se asume que el sistema a modelar es un proceso de Márkov de parámetros desconocidos.

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Protein Data Bank

Protein Data Bank (PDB) (Banco de Datos de Proteínas) es una base de datos de la estructura tridimensional de las proteínas y ácidos nucleicos.

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Wellcome Trust Sanger Institute

El Wellcome Trust Sanger Institute o Instituto Sanger de Cambridge (anteriormente conocido como The Sanger Centre) es una institución sin ánimo de lucro británica dedicada a la investigación genómica y genética.

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