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BioJava

Índice BioJava

BioJava es un proyecto de código abierto dedicado a proveer herramientas Java para el procesamiento de datos biológicos.

Tabla de contenidos

  1. 36 relaciones: Abstract Window Toolkit, Aminoácido, API, Ácido desoxirribonucleico, Base de datos, Bioinformática, BioPerl, Biopython, Blast, Código abierto, Centro Nacional para la Información Biotecnológica, Clase, Coeficiente de extinción, CORBA, CVS, Departamento Administrativo de Seguridad, Disulfuro, EMBOSS, Espectrometría de masas, Extensible Markup Language, FASTA, Fosforilación, GenBank, GitHub, Glucosilación, GNU Lesser General Public License, Java (lenguaje de programación), Java Development Kit, Masa molecular, Maven, Nucleótido, Péptido, PDB, Punto isoeléctrico, Swing (biblioteca gráfica), Transferencia de Estado Representacional.

  2. Software de bioinformática
  3. Software de plataforma Java

Abstract Window Toolkit

La Abstract Window Toolkit (AWT, en español Kit de Herramientas de Ventana Abstracta) es un kit de herramientas de gráficos, interfaz de usuario, y sistema de ventanas independiente de la plataforma original de Java.

Ver BioJava y Abstract Window Toolkit

Aminoácido

Un aminoácido (a veces abreviado como AA), es una molécula orgánica con un grupo amino (-NH2) y un grupo carboxilo (-COOH) en un extremo.

Ver BioJava y Aminoácido

API

Una API (del inglés, application programming interface, en español, interfaz de programación de aplicaciones) es una pieza de código que permite a diferentes aplicaciones comunicarse entre sí y compartir información y funcionalidades.

Ver BioJava y API

Ácido desoxirribonucleico

El ácido desoxirribonucleico —conocido por las siglas ADN— es un ácido nucleico que contiene las instrucciones genéticas usadas en el desarrollo y funcionamiento de todos los organismos vivos y algunos virus (los virus ADN); también es responsable de la transmisión hereditaria.

Ver BioJava y Ácido desoxirribonucleico

Base de datos

Una base de datos (del inglés: database) se encarga no solo de almacenar datos, sino también de conectarlos entre sí en una unidad lógica.

Ver BioJava y Base de datos

Bioinformática

La bioinformática puede definirse, de manera general, como la aplicación de tecnologías computacionales y la estadística a la gestión y análisis de datos biológicos.

Ver BioJava y Bioinformática

BioPerl

BioPerl es un software de código abierto diseñado a partir de la colaboración entre bioinformáticos, biólogos y científicos del área de la computación, ante la necesidad de analizar y resolver problemas de la bioinformática. BioJava y BioPerl son software de bioinformática.

Ver BioJava y BioPerl

Biopython

El proyecto 'Biopython' es el nombre que recibe una serie de aplicaciones y programas informáticos pensados para cuantificar y hacer cálculos con datos biológicos, programados por una comunidad internacional. BioJava y Biopython son software de bioinformática.

Ver BioJava y Biopython

Blast

BLAST es un canal de televisión por satélite angoleño y mozambiqueño dedicado a la transmisión de cine de acción fundada en octubre 31, 2014 por Dreamia - Serviços De Televisão, S.A. El canal transmite en la posición 69 del operador angoleño y mozambiqueño ZAP TV.

Ver BioJava y Blast

Código abierto

El código abierto es un modelo de desarrollo de ''software'' basado en la colaboración abierta.

Ver BioJava y Código abierto

Centro Nacional para la Información Biotecnológica

El Centro Nacional para la Información Biotecnológica (en inglés: National Center for Biotechnology Information) es parte de la Biblioteca Nacional de Medicina de Estados Unidos, una rama de los Institutos Nacionales de Salud (NIH).

Ver BioJava y Centro Nacional para la Información Biotecnológica

Clase

Clase puede referirse a.

Ver BioJava y Clase

Coeficiente de extinción

Coeficiente de extinción puede referirse a distintas magnitudes relacionadas con la absorción de luz en un medio material.

Ver BioJava y Coeficiente de extinción

CORBA

Common Object Request Broker Architecture (CORBA) es un estándar definido por Object Management Group (OMG) que permite que diversos componentes de software escritos en múltiples lenguajes de programación y que corren en diferentes computadoras, puedan trabajar juntos; es decir, facilita el desarrollo de aplicaciones distribuidas en entornos heterogéneos.

Ver BioJava y CORBA

CVS

Concurrent Versions System o simplemente CVS es una aplicación informática que implementa un sistema de control de versiones: mantiene el registro de todo el trabajo y los cambios en los ficheros (código fuente principalmente, en un único archivo para cada fichero correspondiente), que forman un proyecto (de programa) y permite que distintos desarrolladores (potencialmente situados a gran distancia) colaboren.

Ver BioJava y CVS

Departamento Administrativo de Seguridad

El Departamento Administrativo de Seguridad (DAS) fue un organismo estatal encargado de realizar la Inteligencia y Contrainteligencia en Colombia.

Ver BioJava y Departamento Administrativo de Seguridad

Disulfuro

En química y en biología, un disulfuro es un grupo funcional con la estructura general R-S-S-R'.

Ver BioJava y Disulfuro

EMBOSS

EMBOSS es una suite bioinformática de tipo open source creada por EMBnet que es empleada fundamentalmente en biología molecular y genética. BioJava y EMBOSS son software de bioinformática.

Ver BioJava y EMBOSS

Espectrometría de masas

La espectrometría de masas es una técnica de análisis que permite determinar la distribución de las moléculas de una sustancia en función de su masa.

Ver BioJava y Espectrometría de masas

Extensible Markup Language

XML, siglas en inglés de eXtensible Markup Language, traducido como 'Lenguaje de Marcado Extensible' o 'Lenguaje de Marcas Extensible', es un metalenguaje que permite definir lenguajes de marcas desarrollado por el World Wide Web Consortium (W3C) utilizado para almacenar datos en forma legible.

Ver BioJava y Extensible Markup Language

FASTA

FASTA es un paquete de software para el alineamiento de secuencias de ADN y proteínas inicialmente descrito como FASTP por David J. Lipman y William R. Pearson en 1985.

Ver BioJava y FASTA

Fosforilación

La fosforilación es la adición de un grupo fosfato a cualquier otra molécula.

Ver BioJava y Fosforilación

GenBank

GenBank es la base de datos de secuencias genéticas del NIH (National Institutes of Health de Estados Unidos), una colección de disponibilidad pública de secuencias de ADN.

Ver BioJava y GenBank

GitHub

GitHub es una forja (plataforma de desarrollo colaborativo) para alojar proyectos utilizando el sistema de control de versiones Git.

Ver BioJava y GitHub

Glucosilación

La glucosilaciónEssentials of Glycobiology, 2nd edition.

Ver BioJava y Glucosilación

GNU Lesser General Public License

La Licencia Pública General Reducida de GNU, o más conocida por su nombre en inglés GNU Lesser General Public License (antes GNU Library General Public License o Licencia Pública General para Bibliotecas de GNU), o simplemente por su acrónimo del inglés GNU LGPL, es una licencia de software creada por la Free Software Foundation que pretende garantizar la libertad de compartir y modificar el software cubierto por ella, asegurando que el software es libre para todos sus usuarios.

Ver BioJava y GNU Lesser General Public License

Java (lenguaje de programación)

Java es un lenguaje de programación y una plataforma informática que fue comercializada por primera vez en 1995 por Sun Microsystems.

Ver BioJava y Java (lenguaje de programación)

Java Development Kit

# Java Development Kit (JDK) es un software que provee herramientas de desarrollo para la creación de programas en Java.

Ver BioJava y Java Development Kit

Masa molecular

La masa molecular (masa molecular relativa o peso fórmula), cuyo símbolo es mf, es una magnitud que indica cuántas veces la masa de una molécula de una sustancia es mayor que la unidad de masa atómica.

Ver BioJava y Masa molecular

Maven

Maven es una herramienta de software para la gestión y construcción de proyectos Java creada por Jason van Zyl, de Sonatype, en 2002.

Ver BioJava y Maven

Nucleótido

Los nucleótidos son moléculas pequeñas sintetizadas por todos los organismos vivos, que están formadas por la unión de tres elementos: una base nitrogenada, un azúcar simple y un grupo fosfato.

Ver BioJava y Nucleótido

Péptido

Los péptidos son un tipo de molécula formadas por la unión de varios aminoácidos mediante enlaces peptídicos.

Ver BioJava y Péptido

PDB

PDB puede referirse a.

Ver BioJava y PDB

Punto isoeléctrico

El punto isoeléctrico (pI) es el pH al que una molécula tiene carga eléctrica neta cero.

Ver BioJava y Punto isoeléctrico

Swing (biblioteca gráfica)

Swing es una biblioteca gráfica para Java.

Ver BioJava y Swing (biblioteca gráfica)

Transferencia de Estado Representacional

La transferencia de estado representacional (en inglés representational state transfer) o REST es un estilo de arquitectura software para sistemas hipermedia distribuidos como la World Wide Web.

Ver BioJava y Transferencia de Estado Representacional

Ver también

Software de bioinformática

Software de plataforma Java