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ChIP-on-chip

Índice ChIP-on-chip

ChIP-on-chip (también conocido como ChIP-chip) es una tecnología que combina inmunoprecipitación de cromatina (ChIP) con micromatriz de ADN (chip).

Tabla de contenidos

  1. 55 relaciones: ADN complementario, Affymetrix, Algoritmo, Anticuerpo, Ácido desoxirribonucleico, Ácido ribonucleico, Código de histonas, Chip de ADN, CHIP-seq, Cistroma, Complejo de reconocimiento de origen, Cromatina, Desnaturalización (bioquímica), Enhancer, Epítopo, Epigenética, Estadística, Factor de transcripción, Falso color, Fluorescencia, Formaldehído, Gemación, Genoma, Hemaglutinina, Hibridación (biología molecular), Histona, Histona H3, In situ, In vitro, In vivo, Inmunoprecipitación, Inmunoprecipitación de cromatina, Levadura, Lisis, Marco abierto de lectura, Normalización (estadística), Nucleasa microcócica, Nucleosoma, Oligonucleótido, Perfil de expresión génica, Proliferación celular, Promotor (genética), Proteína, Proteínas de unión al ADN, Reacción en cadena de la polimerasa, Recombinación genética, Región intergénica, Regulación de la expresión génica, Replicación de ADN, Represor (genética), ... Expandir índice (5 más) »

ADN complementario

El ADN complementario (ADNc) es una molécula de ADN de una doble cadena, en la que una de sus hebras constituye una secuencia totalmente complementaria al ARN mensajero a partir del cual se ha sintetizado.

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Affymetrix

Affymetrix, Inc. es una compañía estadounidense con sede en Santa Clara, California especializada en el diseño de micromatrices de ADN.

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Algoritmo

En matemáticas, lógica, ciencias de la computación y disciplinas relacionadas, un algoritmo (probablemente del latín tardío algorithmus, y este del árabe clásico ḥisābu lḡubār, que significa «cálculo mediante cifras arábigas») es un conjunto de instrucciones o reglas definidas y no-ambiguas, ordenadas y finitas que permite, típicamente, solucionar un problema, realizar un cómputo, procesar datos y llevar a cabo otras tareas o actividades.

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Anticuerpo

Los anticuerpos, (en la ciencia inmunoglobulinas Ig) son glucoproteínas del tipo gamma globulina.

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Ácido desoxirribonucleico

El ácido desoxirribonucleico —conocido por las siglas ADN— es un ácido nucleico que contiene las instrucciones genéticas usadas en el desarrollo y funcionamiento de todos los organismos vivos y algunos virus (los virus ADN); también es responsable de la transmisión hereditaria.

Ver ChIP-on-chip y Ácido desoxirribonucleico

Ácido ribonucleico

El ácido ribonucleico (ARN) es un ácido nucleico formado por una cadena de ribonucleótidos.

Ver ChIP-on-chip y Ácido ribonucleico

Código de histonas

Se ha postulado una teoría denominada histone code, o código de histonas, según la que modificaciones sobre las colas amino-terminales de las histonas pueden tener consecuencias en cuanto a.

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Chip de ADN

Un chip de ADN (del inglés DNA microarray) es una superficie sólida a la cual se une una colección de fragmentos de ADN.

Ver ChIP-on-chip y Chip de ADN

CHIP-seq

La Inmunoprecipitación de la Cromatina acoplada a Secuenciación, del inglés, ChIP-sequencing (ChIP-seq) es un método de análisis molecular utilizado para identificar los sitios de unión de las proteínas con la molécula de ADN.

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Cistroma

El cistroma se refiere a una colección de elementos reguladores de un conjunto de genes, incluidos los sitios de unión del factor de transcripción y las modificaciones de histonas.

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Complejo de reconocimiento de origen

El complejo de reconocimiento del origen de replicación, o también complejo de reconocimiento de origen, abreviado en la literatura científica como ORC por sus siglas en inglés (Origin recognition complex), es un complejo multiproteico formado por seis proteínas.

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Cromatina

La cromatina es la forma en la que se presenta el ADN en el núcleo celular. Es también la sustancia base de los cromosomas eucarióticos, y corresponde a la asociación de ADN, ARN y proteínas que se encuentran en el núcleo interfásico de las células eucariotas y que constituye el genoma de dichas células.

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Desnaturalización (bioquímica)

En bioquímica, la desnaturalización es un cambio estructural de las proteínas o ácidos nucleicos, donde pierden su estructura nativa, y de esta forma su óptimo funcionamiento y a veces también cambian sus propiedades físico-químicas-estructurales.

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Enhancer

En genética, un enhancer ("potenciador") o amplificador es una corta región del ADN eucariota que puede unirse con proteínas (factores de transcripción) para aumentar los niveles de transcripción de genes en un grupo de genes.

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Epítopo

Un epítopo o determinante antigénico es la porción de una macromolécula que es reconocida por el sistema inmunitario, específicamente la secuencia a la que se unen los anticuerpos, los receptores de las células B o los receptores de las células T. Aunque se piensa que los epítopos provienen de proteínas no propias, las secuencias que se obtienen del huésped que pueden ser reconocidas son también clasificadas como epítopos.

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Epigenética

La epigenética (del griego epi, en o sobre, -genética) o epigenómica es el estudio de los mecanismos que regulan la expresión de los genes sin una modificación en la secuencia del ADN que los compone.

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Estadística

La estadística (la forma femenina del término alemán statistik, derivado a su vez del italiano statista, «hombre de Estado») es la disciplina que estudia la variabilidad, así como el proceso aleatorio que la genera siguiendo las leyes de la probabilidad.

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Factor de transcripción

En biología molecular y genética, un factor de transcripción (a veces llamado factor de unión a una secuencia específica de ADN) es una proteína que se une a secuencias específicas de ADN, controlando así la transcripción de la información genética de ADN a ARN mensajero.

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Falso color

Las técnicas conocidas como falso color se utilizan en la tecnología de imagen (astronomía, imágenes de satélite, imágenes médicas, exploración o minería), donde podemos aprovechar para poner de relieve pequeñas variaciones del color gris.

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Fluorescencia

La fluorescencia es un tipo particular de luminiscencia que caracteriza a las sustancias que son capaces de absorber energía en forma de radiaciones electromagnéticas y luego emitir parte de esa energía en forma de radiación electromagnética de longitud de onda diferente.

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Formaldehído

El formaldehído o metanal es un compuesto químico, más específicamente un aldehído (el más simple de ellos) altamente volátil y muy inflamable, de fórmula H2C.

Ver ChIP-on-chip y Formaldehído

Gemación

La gemación (del latín gemma "joya o brote") es un tipo de reproducción asexual.

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Genoma

El genoma es la secuencia total de ADN que posee un organismo en particular.

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Hemaglutinina

La hemaglutinina es una sustancia (lípido) que causa la aglutinación de los hematíes o glóbulos rojos de la sangre.

Ver ChIP-on-chip y Hemaglutinina

Hibridación (biología molecular)

La hibridación de ácidos nucleicos (ADN o ARN) es un proceso por el cual se combinan dos cadenas de ácidos nucleicos para crear a un híbrido con capacidades alocadas antiparalelas y con secuencias de bases complementarias en una única molécula de doble cadena, que toma la estructura de doble hélice, donde las bases nitrogenadas quedan ocultas en el interior.

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Histona

Las histonas son proteínas básicas, de baja masa molecular, y están muy conservadas (en términos evolutivos) entre los eucariontes.

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Histona H3

La histona H3 es una de las cinco familias principales de proteínas histonas, involucradas en mantener y regular la estructura de la cromatina en células eucariotas.

Ver ChIP-on-chip e Histona H3

In situ

In situ es una expresión latina que significa 'en el sitio' o 'en el lugar', y que suele utilizarse para designar un fenómeno observado en el lugar, o una manipulación realizada en el lugar.

Ver ChIP-on-chip e In situ

In vitro

In vitro (latín: ‘en vidrio’) se refiere a una técnica para realizar un determinado experimento en un tubo de ensayo, o generalmente en un ambiente controlado fuera de un organismo vivo.

Ver ChIP-on-chip e In vitro

In vivo

In vivo (Latín: dentro de lo vivo) significa "que ocurre o tiene lugar dentro de un organismo".

Ver ChIP-on-chip e In vivo

Inmunoprecipitación

La inmunoprecipitación (IP) es una técnica mediante la cual un antígeno proteico es precipitado de una solución haciendo uso de un anticuerpo que se une específicamente a una proteína.

Ver ChIP-on-chip e Inmunoprecipitación

Inmunoprecipitación de cromatina

La Inmunoprecipitación de cromatina (ChIP en inglés) es un método bioquímico de inmunoprecipitación usado para determinar los sitios de unión en el genoma de diversas proteínas in vivo, como histonas modificadas y también se emplea para estudiar la unión de factores de transcripción al ADN.

Ver ChIP-on-chip e Inmunoprecipitación de cromatina

Levadura

Se denomina levadura o fermento a cualquiera de los hongos microscópicos predominantemente unicelulares en su ciclo de vida, generalmente caracterizados por dividirse asexualmente por gemación o bipartición y por tener estados sexuales que no están adjuntos a un micelio o conjunto de hifas.

Ver ChIP-on-chip y Levadura

Lisis

La lisis celular es el proceso de ruptura de la membrana celular de células o bacterias que produce la salida del material celular, provocado por lisinas.

Ver ChIP-on-chip y Lisis

Marco abierto de lectura

En genética, se llama marco abierto de lectura o marco de lectura abierta (ORF, del inglés open reading frame) a la secuencia de ARN comprendida entre un codón de inicio (AUG) de la traducción y un codón de terminación, descontando las secuencias que corresponden a los intrones, en caso de haberlas.

Ver ChIP-on-chip y Marco abierto de lectura

Normalización (estadística)

En estadística y las aplicaciones de estadísticas, la normalización puede tener una gama de significados.

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Nucleasa microcócica

La Nucleasa microcócica, es una endo-exonucleasa que actúa preferentemente sobre ácidos nucleicos de cadena simple produciendo mononucleótidos y oligonucleótidos 3' fosfato.

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Nucleosoma

El nucleosoma es la unidad estructural fundamental de la cromatina, la cual es la forma de empaquetamiento del ADN dentro de los cromosomas de las células eucariotas.

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Oligonucleótido

Un oligonucleótido es una secuencia corta de ADN o ARN, oligómeros, que tienen una amplia gama de aplicaciones en pruebas genéticas, investigación y medicina forense.

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Perfil de expresión génica

En el campo de la biología molecular, el perfil de expresión génica es la medida de la actividad (de la expresión génica) de miles de genes simultáneamente, para crear una imagen global de la función celular.

Ver ChIP-on-chip y Perfil de expresión génica

Proliferación celular

La proliferación celular es el proceso por el cual una célula crece y se divide para producir dos células hijas.

Ver ChIP-on-chip y Proliferación celular

Promotor (genética)

En genética un promotor es una región de ADN que controla la iniciación de la transcripción de una determinada porción del ADN a ARN.

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Proteína

Las proteínas o prótidos son macromoléculas formadas por cadenas lineales de aminoácidos.

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Proteínas de unión al ADN

Las proteínas de unión al ADN son proteínas que tienen dominios de unión al ADN y, por lo tanto, tienen una afinidad específica o general por el ADN monocatenario o bicatenario.

Ver ChIP-on-chip y Proteínas de unión al ADN

Reacción en cadena de la polimerasa

La técnica de la reacción en cadena de la polimerasa (en inglés, polymerase chain reaction o PCR) es una técnica de la biología molecular desarrollada en 1986 por Kary Mullis.

Ver ChIP-on-chip y Reacción en cadena de la polimerasa

Recombinación genética

La recombinación genética es el proceso por el cual una hebra de material genético (usualmente ADN, pero también puede ser ARN) se corta y luego se une a una molécula de material genético diferente.

Ver ChIP-on-chip y Recombinación genética

Región intergénica

Una región intergénica (IGR) es un tramo de secuencias de ADN ubicadas entre genes.

Ver ChIP-on-chip y Región intergénica

Regulación de la expresión génica

La regulación génica comprende todos aquellos procesos celulares que aumentan o disminuyen los productos finales de los genes (proteínas o ARN).

Ver ChIP-on-chip y Regulación de la expresión génica

Replicación de ADN

El proceso de replicación, autorreplicación, duplicación o autoduplicación de ADN es el mecanismo que permite al ADN duplicarse (es decir, sintetizar una copia idéntica).

Ver ChIP-on-chip y Replicación de ADN

Represor (genética)

En genética molecular, un represor es una proteína de unión a ADN o ARN que inhibe la expresión de uno o más genes al unirse al operador o silenciadores asociados.

Ver ChIP-on-chip y Represor (genética)

Reticulación

La reticulación es una reacción química presente en la química de los polímeros.

Ver ChIP-on-chip y Reticulación

Saccharomyces cerevisiae

La levadura de cerveza (Saccharomyces cerevisiae) Meyen ex E.C.Hansen, de Saccharo azúcar, myces hongo y cerevisiae cerveza es un hongo unicelular, un tipo de levadura utilizado industrialmente en la fabricación de pan, cerveza y vino.

Ver ChIP-on-chip y Saccharomyces cerevisiae

Silenciador (genética)

En genética, un silenciador es una secuencia de ADN capaz de unirse a factores de regulación de la transcripción, llamados represores.

Ver ChIP-on-chip y Silenciador (genética)

Sitio de unión

En bioquímica, un sitio de unión (en inglés binding site, sitio de enlace) es una región de una proteína, ADN o ARN en la que otra molécula o ion específicos forma un enlace químico.

Ver ChIP-on-chip y Sitio de unión

Sonicación

La sonicación es el acto de aplicación de la energía del sonido (generalmente ultrasonidos) para agitar las partículas de una muestra, con diversos fines científicos o industriales.

Ver ChIP-on-chip y Sonicación

, Reticulación, Saccharomyces cerevisiae, Silenciador (genética), Sitio de unión, Sonicación.